| Statuss(Neaktīvs) | Izdruka | Arhīvs(0) | Studiju plāns Vecais plāns | Kursu katalogs | Vēsture |
| Kursa nosaukums | Biosistēmu modelēšanas pamati |
| Kursa kods | InfT3015 |
| Zinātnes nozare | Elektrotehnika, elektronika, informācijas un komunikāciju tehnoloģijas |
| Zinātnes apakšnozare | Datorvadība |
| Kredītpunkti (ECTS) | 3.75 |
| Kopējais stundu skaits kursā | 101.25 |
| Lekciju stundu skaits | 24 |
| Semināru un praktisko darbu stundu skaits | 16 |
| Kursa apstiprinājuma datums | 19/10/2011 |
| Atbildīgā struktūrvienība | Datoru sistēmu un datu zinātnes institūts |
| Kursa izstrādātājs(-i) | |
| Dr. sc. ing., Egils Stalidzāns |
|
| Priekšzināšanas Kursam priekšzināšanas nav nepieciešamas |
|
| Kursa anotācija | |
| Biosistēmu modelēšana ir iedarbīgs līdzeklis bioloģisku objektu darbības izpratnes uzlabošanai dažādos modelēšanas mērogos: iekššūnu bioķīmiskie procesi, šūnu komunikācija, audi, orgāni, organisms, orgāns, populācija un ekosistēma. Kursā paredzēts dot ieskatu dažādu līmeņu bioprocesu modelēšanas īpatnībās un kopīgajās īpašībās vēršot uzmanību uz piemērotu programmproduktu izvēli dažādu modelēšanas mērogu gadījumā. | |
| Kursa rezultāti un to vērtēšana | |
| • Zināšanas par dažādu mērogu bioloģisko sistēmu modelēšanas īpatnībām un atšķirīgu mērogu modeļu savstarpējo saistību;
• prasmes izvēlēties modelējamajai bioloģiskajai problēmai piemērotu modelēšanas mērogu un programmproduktu, spēt interpretēt modelēšanas rezultātus; • kompetence izmantot Matlab un brīvpieejas programmproduktus bioloģisku problēmu risināšanā darbojoties individuāli vai grupā, spēt pamatot modelēšanas nozīmi un ekonomisko efektu ar bioprocesiem saistītu ražošanas uzņēmumu pārstāvjiem. |
|
| Kursa saturs(kalendārs) | |
| 1 Intergrējoša elementa dinamiska modeļa izveide.
2 Intergrējoša elementa dinamiska modeļa izveide. 3 Intergrējoša elementa dinamiska modeļa izveide. 4 Intergrējoša elementa dinamiska modeļa izveide. 5 Stehiometriskā modeļa izveide. 6 Stehiometriskā modeļa izveide. 7 Stehiometriskā modeļa izveide. 8 Dinamiskā modeļa izveide. 9 Dinamiskā modeļa izveide. 10 Dinamiskā modeļa izveide. 11 Dinamiskā modeļa analīze. 12 Dinamiskā modeļa analīze. 13 Dinamiskā modeļa analīze. 14 Dinamiskā modeļa optimizācija. 15 Dinamiskā modeļa optimizācija. 16 Dinamiskā modeļa optimizācija. |
|
| Prasības kredītpunktu iegūšanai | |
| Izstrādāts un aizstāvēts praktiskais darbs. | |
| Obligātā literatūra | |
| 1. Selga T. Šūnu bioloģija. Rīga: LU Akadēmiskais apgāds. 2008. 343 lpp.
2. Palsson B. O. Systems Biology: Properties of Reconstructed networks, Cambridge University Press, 2006. 3. Renshaw E. Modelling biological populations in space and time. Cambridge University Press, 1995. |
|
| Papildliteratūra | |
| 1. Szallasi Z., Stelling J., Periwal V. System Modelling in Cell Biology from concepts to nuts and bolts, MIT Press, 2006. | |
| Piezīmes | |
| Virziena speciālais kurss akadēmiskā studiju programma “Datorvadība un datorzinātne”. | |