Kursa nosaukums | Diskrētās biosistēmas |
Kursa kods | InfT3014 |
Zinātnes nozare | Informācijas tehnoloģija (nav zn) |
Kredītpunkti (ECTS) | 3 |
Kopējais stundu skaits kursā | 81 |
Lekciju stundu skaits | 16 |
Semināru un praktisko darbu stundu skaits | 16 |
Studenta patstāvīgā darba stundu skaits | 49 |
Kursa apstiprinājuma datums | 12/01/2016 |
Atbildīgā struktūrvienība | Datoru sistēmu un datu zinātnes institūts |
Kursa izstrādātājs(-i) | |
Dr. sc. ing., Egils Stalidzāns |
|
Priekšzināšanas Kursam priekšzināšanas nav nepieciešamas |
|
Kursa anotācija | |
Datorsistēmas balstās uz diskrētiem notikumiem – darbībām ar informācijas vienībām. Biosistēmu diskrētums tiek uzsvērts dažādos diskrētos molekulāros notikumos šūnu iekšienē metabolisma, komunikācijas un signalizācijas procesos. Tiek analizēti biosistēmu darbības principu pārneses iespējas uz skaitļošanas tehnoloģijām, kā arī bioloģisku sistēmu pielietošana skaitļošanas vai datu glabāšanas realizācijai. Tiek apskatīts arī biodatora jēdziens. | |
Kursa rezultāti un to vērtēšana | |
• Zināšanas par līdzībām starp bioloģiskajām un skaitļošanas sistēmām informācijas pārstrādes un glabāšanas ziņā;
• prasmes novērtēt informācijas apstrādes procesu līdzības neatkarīgi no to izpildes mehānismu īpatnībām; • kompetence adaptēt biosistēmas pielietotus informācijas apstrādes principus skaitļošanas uzdevumu risināšanai, izveidot to matemātisko aprakstu. |
|
Kursa saturs(kalendārs) | |
1 Stohastisko un deterministisko dinamisko modeļu salīdzināšana.
2 Stohastisko un deterministisko dinamisko modeļu salīdzināšana. 3 Stohastisko un deterministisko dinamisko modeļu salīdzināšana. 4 Stohastisko un deterministisko dinamisko modeļu salīdzināšana. 5 Mutācijas un krustmijas procesu modelēšana. 6 Mutācijas un krustmijas procesu modelēšana. 7 Mutācijas un krustmijas procesu modelēšana. 8 Diskrēta rauga metabolisma modeļa analīze. 9 Diskrēta rauga metabolisma modeļa analīze. 10 Diskrēta rauga metabolisma modeļa analīze. 11 Mutācijas un krustmijas procesu modelēšana. 12 Diskrēts signalizācijas tīkla modelis. 13 Diskrēts signalizācijas tīkla modelis. 14 Diskrēts signalizācijas tīkla modelis. 15 Diskrēts signalizācijas tīkla modelis. 16 Diskrēts signalizācijas tīkla modelis. |
|
Prasības kredītpunktu iegūšanai | |
Izstrādāts un aizstāvēts praktiskais darbs. | |
Obligātā literatūra | |
1. Forbes N., Imitation of Life. How biology is inspiring computing. Massachusets: MIT Press Cambridge, 2005.
2. Selga T., Šūnu bioloģija. Rīga: LU Akadēmiskais apgāds. 2008. 343 lpp. 3. Palsson B.O. Systems Biology: Properties of Reconstructed networks. Cambridge: Cambridge University Press, 2006. 4. Wagner A., Robustness and Evolvability in Living Systems Princeton University Press, 2005. |
|
Papildliteratūra | |
1. Szallasi Z., Stelling J., Periwal V. System Modelling in Cell Biology from concepts to nuts and bolts, MIT Press, 2006. 2. Kratz R.F. Molecular and Cell Biology for Dummies. Wiley Publishing Inc. | |
Piezīmes | |
Virziena speciālais kurss ITF studentiem, akadēmiskā studiju programma “Datorvadība un datorzinātne”. |