Latviešu Krievu Angļu Vācu Franču
Statuss(Neaktīvs) Izdruka Arhīvs(0) Studiju plāns Vecais plāns Kursu katalogs Vēsture

Kursa nosaukums Biosistēmu modelēšana
Kursa kods InfT2020
Zinātnes nozare Elektrotehnika, elektronika, informācijas un komunikāciju tehnoloģijas
Zinātnes apakšnozare Datorvadība
Kredītpunkti (ECTS) 4.5
Kopējais stundu skaits kursā 121.5
Lekciju stundu skaits 16
Laboratorijas darbu stundu skaits 32
Kursa apstiprinājuma datums 12/01/2016
Atbildīgā struktūrvienība Datoru sistēmu un datu zinātnes institūts
 
Kursa izstrādātājs(-i)
Dr. sc. ing., Egils Stalidzāns

Priekšzināšanas
Kursam priekšzināšanas nav nepieciešamas
 
Kursa anotācija
Modeļa sastādīšana un tā izmantošana procesu prognozei un optimizācijai ir svarīgas prasmes mūsdienu biotehnoloģijā, medicīnā un ekoloģijā. Kursā apskatīts bioloģisku sistēmu modeļu izveides un pielietošanas cikls, kas ietver gan modeļa struktūras, gan tā dinamisko parametru noskaidrošanu nepilnīgas informācijas apstākļos. Par piemēriem tiek izmantoti dažādu mērogu modeļi – no šūnu procesu modeļiem līdz populācijas līmeņa modeļiem.
Kursa rezultāti un to vērtēšana
• Zināšanas par datormodeļu izveides galvenajiem posmiem izgūstot maksimālu informācijas daudzumu no pieejamajiem eksperimentālajiem datiem un literatūras;
• prasmes izvēlēties pieejamajam informācijas daudzumam atbilstošu modelēšanas tehniku, salīdzināt un kritiski izvērtēt dažādus literatūras avotus; • kompetence izmantot modelēšanas tehnikas dažādu bioprocesu uzlabojumu veikšanai aizvietojot eksperimentus ar datorsimulācijām, spēt pārliecināt biotehnoloģiski orientētu uzņēmumu vadību par modelēšanas pieejas efektivitāti.
Kursa saturs(kalendārs)
1 Struktūrmodeļa izveide.
2 Struktūrmodeļa izveide.
3 Struktūrmodeļa izveide.
4 Dinamiskā modeļa izveide.
5 Dinamiskā modeļa izveide.
6 Dinamiskā modeļa izveide.
7 Dinamiskā modeļa izveide.
8 Dinamiskā modeļa izveide.
9 Dinamiskā modeļa izveide.
10 Dinamiskā modeļa izveide.
11 Dinamiskā modeļa izveide.
12 Dinamiskā modeļa optimizācija.
13 Dinamiskā modeļa optimizācija.
14 Dinamiskā modeļa optimizācija.
15 Dinamiskā modeļa optimizācija. 16 Dinamiskā modeļa optimizācija.
Prasības kredītpunktu iegūšanai
Izstrādāts un aizstāvēts praktiskais darbs.
Obligātā literatūra
1. Selga T. Šūnu bioloģija. Rīga: LU Akadēmiskais apgāds. 2008. 343 lpp.
2. Palsson B. O. Systems Biology: Properties of Reconstructed networks, Cambridge University Press, 2006. 3. Renshaw E. Modelling biological populations in space and time. Cambridge University Press, 1995.
Papildliteratūra
1. Szallasi Z., Stelling J., Periwal V. System Modelling in Cell Biology from concepts to nuts and bolts, MIT Press, 2006.
Piezīmes
Speciālā kursa obligātais studiju kurss akadēmiskajā maģistra studiju programmā.