| Statuss(Neaktīvs) | Izdruka | Arhīvs(0) | Studiju plāns Vecais plāns | Kursu katalogs | Vēsture |
| Kursa nosaukums | Datortehnoloģijas biosistēmu vadībā |
| Kursa kods | InfT1029 |
| Zinātnes nozare | Elektrotehnika, elektronika, informācijas un komunikāciju tehnoloģijas |
| Zinātnes apakšnozare | Datorvadība |
| Kredītpunkti (ECTS) | 2.25 |
| Kopējais stundu skaits kursā | 60.75 |
| Lekciju stundu skaits | 16 |
| Semināru un praktisko darbu stundu skaits | 8 |
| Kursa apstiprinājuma datums | 19/10/2011 |
| Atbildīgā struktūrvienība | Datoru sistēmu un datu zinātnes institūts |
| Kursa izstrādātājs(-i) | |
| Dr. sc. ing., Egils Stalidzāns |
|
| Priekšzināšanas Kursam priekšzināšanas nav nepieciešamas |
|
| Kursa anotācija | |
| Biosistēmu vadība ir kļuvusi par vienu no datorzinātņu un datorvadības pielietojuma nozarēm ar lielu attīstības potenciālu biotehnoloģijās, medicīnā, ekoloģijā un enerģētikā. Priekšmetā paredzēts dot informācijas tehnoloģiju speciālistiem piemērotā formā veidotu informāciju par bioloģisku sistēmu pamatiem un datortehnoloģiju saistību ar jaunākajiem zinātnes sasniegumiem bioinformātikā (statistika un datu analīze) un sistēmbioloģijā (modelēšana un dinamikas analīze). Apskatīti kibernētikas un sistēmu teorijas pamati, kas saista bioloģiskās sistēmas ar tehniskajām vienotā formālajā analīzē. | |
| Kursa rezultāti un to vērtēšana | |
| • Zināšanas par galvenajām bioloģisko un tehnisko procesu kopējām iezīmēm, bioloģiskas sistēmas darbības pamatprincipiem šūnu līmenī;
• prasmes analizēt ģenētisko informāciju, salīdzināt dažādu organismu gēnu sekvences, izsekot ģenētisko izmaiņu potenciālajām sekām bioloģiskā vadības sistēmā, interpretēt dinamiska modeļa simulāciju rezultātus; • kompetence izmantot brīvpieejas bioloģiskās informācijas analīzes rīkus bioloģisko vadības procesu modelēšanā un prognozēšanā, spēt analizēt un plānot bioprocesu modelēšanas un optimizācijas procesus. |
|
| Kursa saturs(kalendārs) | |
| 1 Gēnu homoloģijas analīze ar brīvpieejas rīku palīdzību.
2 Gēnu homoloģijas analīze ar brīvpieejas rīku palīdzību. 3 Gēnu homoloģijas analīze ar brīvpieejas rīku palīdzību. 4 Gēnu homoloģijas analīze ar brīvpieejas rīku palīdzību. 5 Gēnu homoloģijas analīze ar brīvpieejas rīku palīdzību. 6 Gēnu homoloģijas analīze ar brīvpieejas rīku palīdzību. 7 Gēnu homoloģijas analīze ar brīvpieejas rīku palīdzību. 8 Gēnu homoloģijas analīze ar brīvpieejas rīku palīdzību. 9 Dinamiska modeļa izveide COPASI. 10 Dinamiska modeļa izveide COPASI. 11 Dinamiska modeļa izveide COPASI. 12 Dinamiska modeļa izveide COPASI. 13 Dinamiska modeļa izveide COPASI. 14 Dinamiska modeļa izveide COPASI. 15 Dinamiska modeļa izveide COPASI. 16 Dinamiska modeļa izveide COPASI. |
|
| Prasības kredītpunktu iegūšanai | |
| Izstrādāts un aizstāvēts praktiskais darbs. | |
| Obligātā literatūra | |
| 1. Ratledge C., Kristiansen B. Basic Biotechnology, 3rd edition. Cambridge: Cambridge University Press, 2007. 666 p.
2. Renshaw, E. Modelling biological populations in space and time. Cambridge: Cambridge University Press, 1995. 3. Klipp E., Herwig R., Kowald A., Wierling C., Lehrach H. Systems Biology in Practice. Concepts, Inplementation and Application. WILEY-VCH Verlag GmbH&Co KgaA, 2006. 4. Jones D.S. Sleeman B.D. Differential Equations and Mathematical Biology. Chapman &Hall/CRC, 2003. |
|
| Papildliteratūra | |
| 1. Szallasi Z., Stelling J., Periwal V. System Modelling in Cell Biology from concepts to nuts and bolts, MIT Press, 2006. 2. Davidson E.H. The regulatory Genome. Gene regulatory networks in development and evolution. Academic Press, Elsevier, 2006. | |
| Piezīmes | |
| Obligātais kurss ITF studentiem, akadēmiskā studiju programma “Datorvadība un datorzinātne”. | |