Excel
Kursa nosaukums Bioinformātika I
Kursa kods Biol5008
Zinātnes nozare Bioloģija
Zinātnes apakšnozare Biometrija un bioinformātika
Kredītpunkti (ECTS) 4.5
Kopējais stundu skaits kursā 121.5
 
Priekšzināšanas
Kursam priekšzināšanas nav nepieciešamas
 
Kursa anotācija
Magistranti apgūs kultūraugu un to sējumu veidošanas tehnoloģijas, kā sarežģītu bioekoloģisko sistēmu. Apgūt šīs sistēmas atsevišķo procesu modelēšanas principus, kultūraugu produktivitātes veidošanas bāzes modeļa struktūras, kultūraugu produktivitātes un kvalitātes veidošanās dinamiskos modeļus.
Kursa saturs(kalendārs)
1 Ievads. Bioinformātika kā zinātne un mācību priekšmets, tās saskare ar citām zinātnēm.
2 Agrobiocenozes, to sastāvs un funkcionālā darbība.
3 Agrobiocenožu struktūra un funkcionāla organizācija.
4 Enerģijas apmaiņa agrobiocenozēs un barības vielu aprite dabā.
5 Laukaugu ražību ietekmējošie agroekoloģiskie faktori, to savstarpējā sakarība un vienotība.
6 Saules radiācija un tās sadalījums, fotosintētiski aktīvā radiācija (FAR), tiešā, atstarotā, izkliedētā.
7 Temperatūra un augu augšana un attīstība, pozitīvās, aktīvās un efektīvās temperatūras, to sadalījums.
8 Ūdens kā viens no svarīgākajiem augu dzīves faktoriem. Kopējais un produktīvais ūdens daudzums.
9 Gaisa cirkulācija sējumā. Gāzu apmaiņa starp augsni, sējumu un augstākiem slāņiem.
10 Fotosintezējošā virsma sējumā - galvenais ražas veidotājfaktors.
11 Augu barības vielu režīms un agrotehnisko pasākumu komplekss kā labvēlīgu augšanas un attīstības faktori.
12 Agrobiocenožu modelēšana. Modeļu nozīme lauksaimniecībā. Lauksaimniecības objektu modelēšanas pamatprincipi. 13 Siltuma un mitruma pārnešana augsnē, tā modelēšanas principi. Siltuma un mitruma pārnešana sējumos, modelēšana
Prasības kredītpunktu iegūšanai
Iepriekš jābūt nodotam un aizstāvētam kursa darbam.
Obligātā literatūra
1. Arthur M. Lesk (2002) Introduction to Bioinformatics/ Oxford, University Press/ New York/ 283.pp.
2. Grundlagen der landwirtschaftlichen Pflanzenproduktion / Verlag Eugen Ulmen. 1997.- 860 s.
3. Одум Ю. Экология : в 2-х т. Т. 1.; T. 2 : Перевод с англ. Москва : Мир, 1986.- 328 с. 4. Часовенная А. А. Основы агрофитоценологии. Учебное пособие. ЛГУ, 1975.- 187 с.
Papildliteratūra
1. Биоценозы, среда и человек / Шатилов Ф.В., Болдырев П.Т., Сирогин А.А. Сарат Г.У. 1986.- 236 с.
2. Бондаренко Н.Т. Моделирование продуктивности агроэкосистем. Лиесма : Гидрометеоиздат, 1982.- 262 с.
3. Полуэктов Р.А. Динамические модели агроэкосистем. Лиесма : Гидрометеоиздат, 1991.- 311 с. 4. Проблемы биоценологии / Под. ред. Лавренко Е. М., Работнов Т.А., Москва : Наука, 1973.- 228 с.
Periodika un citi informācijas avoti
1. Information System for Regional agricultural business and extension (http://ikta.date.hu/)
Piezīmes
Obl. speciālais kurss ITF maģistrantiem, 1.kurss 1.sem. pilna laika un 2.k. 4. sem. nepilna laika stud. progr. „Informācijas tehnoloģijas” virziens „Informācijas tehnoloģijas biosistēmās”, eksāmens.