LV EN RU DE FR

Šūnu vadības analīze

Kursa izstrādātājs

Kursa anotācija

Ar bioloģisko šūnu procesu modelēšanu saistītās zinātnes nozares – bioinformātika, sistēmbioloģija un sintētiskā bioloģija ir vērstas uz evolucionāri izveidojušos bioloģisko procesu izpratni un iegūtās izpratnes pielietojumiem šo procesu mainīšanā ar dažādiem mērķiem – panākt šūnu funkcionēšanu saskaņā ar 1) biznesa mērķiem (šūnas – rūpnīcas, biotehnoloģija, bioenerģētika) vai 2) normalizēt šūnu un organismu darbību (veselības aizsardzība, personalizētā medicīna, ekoloģija). Apskatītas šūnu vadības procesu mērķtiecīgas mainīšanas un normalizācijas pieejas.

Kursa rezultāti un to vērtēšana

• Zināšanas par vadības sistēmu analīzes metodēm statiskos un dinamiskos modeļos un nepieciešamo sistēmas darbības izmaiņu realizācijas iespējām;
• prasmes izvēlēties pētāmajam vadības uzdevumam piemērotu modeļa apjomu, tipu un analīzes metodes, veikt dinamisku vadības procesu analīzi;
• kompetence izmantot vadības sistēmu modelēšanas metodes uzdevumu risināšanai dažādās biorūpniecības un medicīnas jomās, darboties starpdisciplinārās komandās, spēt izvērtēt un pamatot modelēšanas iespējas samazināt eksperimentālo darbu ar šūnām.

Kursa saturs(kalendārs)

1 Stabilu, nestabilu un oscilējošu procesu modeļu analīze.
2 Stabilu, nestabilu un oscilējošu procesu modeļu analīze.
3 Stabilu, nestabilu un oscilējošu procesu modeļu analīze.
4 Stabilu, nestabilu un oscilējošu procesu modeļu analīze.
5 Stabilu, nestabilu un oscilējošu procesu modeļu analīze.
6 Stabilu, nestabilu un oscilējošu procesu modeļu analīze.
7 Sintētiskās bioloģijas elementu analīze Biobricks.org datu bāzē.
8 Sintētiskās bioloģijas elementu analīze Biobricks.org datu bāzē.
9 Sintētiskās bioloģijas elementu analīze Biobricks.org datu bāzē.
10 Sintētiskās bioloģijas elementu analīze Biobricks.org datu bāzē.
11 Iekārtu veidošana no Biobricks datu bāzes elementiem.
12 Iekārtu veidošana no Biobricks datu bāzes elementiem.
13 Iekārtu veidošana no Biobricks datu bāzes elementiem.
14 Iekārtu veidošana no Biobricks datu bāzes elementiem.
15 Iekārtu veidošana no Biobricks datu bāzes elementiem.
16 Iekārtu veidošana no Biobricks datu bāzes elementiem.

Prasības kredītpunktu iegūšanai

Praktisko darbu izpildes (apraksta) pārbaude, ieskaite ar atzīmi.

Obligātā literatūra

1. Palsson B.O. Systems Biology: Properties of Reconstructed networks, Cambridge University Press, 2006.
2. Renshaw E. Modelling biological populations in space and time. Cambridge University Press, 1995.

Papildliteratūra

1. Szallasi Z., Stelling J., Periwal V. System Modelling in Cell Biology from concepts to nuts and bolts, MIT Press, 2006.
2. Systems Biology. Definitions and Perspectives. Editors L. Alberghina, H.V. Westerhoff, Springer, 2005.

Piezīmes

Speciālā kursa obligātais studiju kurss akadēmiskajā maģistra studiju programmā.